Tallinna Tehnikaülikool

Keemia ja biotehnoloogia instituudi doktorant Sameera Anant Vipat kaitseb 19. juunil 2025 algusega kell 15:00 oma doktoritööd "The Roles of TIMELESS Protein and DNA Polymerase Epsilon in DNA Replication Initiation in Human Cells" ("TIMELESS valgu ja DNA polümeraas epsiloni rollid DNA replikatsiooni initsiatsioonis inimese rakkudes"). Kaitsmine toimub Tallinna Tehnikaülikooli loodusteaduste maja ruumis SCI-109 (Akadeemia tee 15).

DNA replikatsiooni initsiatsioon on selle protsessi kiirust piirav etapp, mis määrab replikatsiooni toimumise sageduse, kuna ühe raku-jagunemise kohta peab toimuma ainult üks replikatsioonisündmus. Replikatsioonikahvli kaitsekompleksi (FPC) komponendi TIMELESS (TIM) rollist initsiatsioonis on teada vaid asjaolu, et TIM-i kadumine kahjustab S-faasi sisenemist. Samamoodi on DNA polümeraasi epsiloni (POLE) katalüütilised funktsioonid hästi uuritud, kuid mittekatalüütilised rollid jällegi on võrdlemisi alauuritud. 
Mõlema valgu rolli uurimiseks replikatsiooni initsiatsioonil kasutasime tingimuslikku auksiin-indutseeritava degroni tehnoloogiat, mille abil on võimalik tingimuslikult kaotada uuritava valgu avaldumine rakkudes. Leidsime, et TIM toetab S-faasi sisenemist, värvates valgukompleksi TIPIN ja CLASPIN valgud ning toetades PCNA õigeaegset värbamist replikatsiooni initsiatsiooni ajal. Samuti leidsime, et POLE katalüütilise alaühiku mittekatalüütiline domeen POLE1 toetab initsiatsiooni, säilitades normaalse replikatsioonikahvli kiiruse. Kokkuvõttes on käesoleva töö tulemustena leitud TIM-i ja POLE olulisi ja varem tundmatuid funktsioone inimese rakkude replikatsiooni initsiatsioonis. DNA replikatsiooni on inimestel võrreldes mudelorganismi pärmiga alauuritud ja inimsüsteemi uuringud on hädavajalikud mitte ainult selleks, et parandada meie arusaamist sellest väga kesksest molekulaarbioloogilisest protsessist, vaid ka selleks, et panna alus tulevastele ravimeetoditele.

Doktoritöö on avaldatud Tehnikaülikooli raamatukogu digikogus

Juhendaja külalisteadur Tatiana Moiseeva (TalTech)

Oponendid:

  • kaasprofessor Ivar Ilves (Tartu Ülikool, Eesti)
  • abiprofessor Logan Myler (Pittsburghi Ülikool, USA)