Merendussektor vajab teadusliku töökogemusega eksperte õppejõududeks, teadlasteks nii era- kui ka avalikku sektorisse, selleks, et tagada Eestis merenduse valdkonna jätkusuutlik areng. Merenduse doktorikavale on oodatud merenduse valdkonna magistrid aga ka teiste erialade lõpetanud, kes on motiveeritud doktoriõpingute käigus omandama merendusalase laia silmaringi ning vajalikud teadmised ja oskused.
Merenduse peaeriala eesmärk on omandada teadmised, oskused ja kogemused iseseisvaks teadus-, arendus-, õppe- või kutsealaseks tööks merenduse valdkonnas. Õppekava eesmärk on viia doktorandi teadmised ja oskused rahvusvahelises teadusruumis tunnustatud kõrgprofessionaali tasemele.
Eesti Mereakadeemial on koostöös inseneriteaduskonnaga üks doktoriõppekava - mehhanotehnika, peaeriala merendus.